Луиджи всегда находился в тени своего известного брата, но ему это порядком надоело, поэтому он решил отправиться в новое приключение один. По сюжету игры профессор Элвин проводил испытания в своей лаборатории. Он изучал особенности поведения дружелюбных привидений, причем изучения эти происходили до тех пор, пока не появился призрак по имени Король Бу. Он разбил в небе Луну, в результате чего все привидения стали очень злыми. Теперь профессор вынужден прятаться в бункере и обратиться за помощью к Луиджи, чтобы тот помог собрать всех призраков в особняке и передать их в руки профессора.
